Trattamento con amikacina per infezione urinaria, può essere pericoloso?

Buongiorno,
il primo di Luglio sono stata ricoverata per due settimane in urologia a seguito di una colica renale dovuta alla presenza di un calcolo che bloccava l'uretere e a causa di una forte infezione da Klebsiella Pneumoniae che aveva intaccato anche il rene causando una pielonefrite plurifocale e stava iniziando a espandersi anche nei polmoni.
Mi è stato inserito uno stent ureterale che dovrei rimuovere il 10 ottobre e sono stata trattata con Ciprofloxacina, Meropenem e Gentamicina.
Al rientro a casa ho assunto ciprofloxacina per altri 5 giorni e poi mi è stato rimosso il catetere vescicale.

I primi di agosto ho effettuato esami urine e urinocoltura e sono risultata ancora positiva alla klebsiella, ho fatto un ciclo di amoxcillina di 6 giorni.

Nella tac effettuata il 16 agosto la situazione era in miglioramento, il calcolo più grande era stato eliminato e l'infiammazione al rene e ai polmoni era in diminuzione.

Da circa tre settimane però sto avendo continuamente i sintomi della cisitite, ho fatto un ciclo di sei giorni di ciprofloxacina e poi effettuato gli esami delle urine e urinocoltura dopo tre giorni dalla fine dell'antibiotico.

Risulto ancora positiva alla Klebsiella e ora il medico mi ha prescritto sei giorni di trattamento con Amikacina, in quanto dall'antibiogramma risulterebbe essere quella più efficace.

Sono molto restia però a procedere... ho visto che l'amikacina può avere effetti indesiderati molto gravi e irreversibili, anche a livello renale e dato che il mio rene sinistro è già stato compromesso dall'infezione, non vorrei peggiorare la situazione.
Inoltre ho letto che può causare sordità irreversibile e la cosa mi spaventa molto...
In questo momento sto assumendo Allupurinolo e citrato di potassio per sciogliere i calcoli.

Come mi consiglia di procedere?
E' sicuro fare il trattamento?