Infezioni da eterococcus(urine) e e.coli(seme)

Salve medici,vi scrivo per un consiglio e per togliermi un dubbio,ultimamente accusando piccoli bruciori mentre urinavo e dolori al tatto agli epididimi,ho deciso di farmi seguire da un Urologo,mi ha consigliato vari esami da eseguire,tra cui urinocoltura (ris.infezione da E.Coli) e spermiocoltura (ris. Infezione Klebsiella),il medico mi ha prescritto agilev 500 per 10 giorni,dopo altri 10 ripeto gli esami e sta volta dall'urinocoltura (ris.infezione da Eterococcus) e spermiocoltura (ris.infezione da E.Coli) che sto trattando da 3 giorni con Amoxicillina 125 due volte al giorno,mi chiedo perché secondo voi il primo antibiotico non ha eliminato l'infezione e tali batteri? Amoxicillina può essere quella decisiva per la mia cura? E il mio dubbio: posso praticare sesso non protetto?rischio di trasmettere le infezioni alla mia compagna? Lei Comunque dall'urinocoltura non ha avuto alcun risultato di infezioni in corso....grazie in anticipo per le risposte!