Attività fisica e dolore ai ginocchi

Salve,
Innanzitutto la ringrazio anticipatamente per la sua risposta.
Da gennaio 2010 sono afflitto da dolore ad entrambi i ginocchi, prima il destro, poi anche il sinistro. Ho 19 anni, altezza 1,75, peso 62 kg. Prima della comparsa della patologia praticavo tre sport: ciclismo (3 uscite a settimana di circa 4 ore, corsa 2 uscite di 40 minuti e karate, 3 allenamenti da un’ora). Prima d’ora non avevo mai avuto alcun problema fisico.
Tutto è iniziato quando durante un’uscita in bicicletta, è sorto improvvisamente un dolore crescente al ginocchio dx, seguito da una borsite piuttosto acuta, con gonfiore e forte calore sulla zona anteriore del ginocchio, e fitte acute ogniqualvolta sollevavo il ginocchio (ad esempio per fare le scale). Poco dopo, nonostante l’interruzione dell’attività sportiva, anche il ginocchio sx a cominciato a farsi sentire, seppur senza presentare infiammazioni.
Su consiglio dell’ortopedico pratico ghiaccio sulle ginocchia e smetto per due mesi con bici e corsa, ma continuo con karate e introduco un po’ di nuoto. L’ortopedico, sospettando un cattivo allineamento della rotula, mi prescrive una radiografia su rotazione assiale delle rotule a 30-60-90 gradi di flessione delle ginocchia, eco il risultato dell’esame: Non si apprezzano segni di lesioni ossee a focolaio. Regolare il trofismo osseo e i rapporti articolari. Inoltre il medico mi prescrive degli esercizi di potenziamento del quadricipite, da praticarsi con l’ausilio dei pesi in palestra, senonchè tali esercizi non fanno che aumentare il dolore, per cui li interrompo.
Dopo i due mesi d’attivita “controllata”, riprendo progressivamente il ciclismo (ma non la corsa), il dolore, seppur molto ridotto, persiste, anche se a fasi alterne, ora aumentando, ora riducendosi sin quasi a scomparire del tutto (e lasciandomi l’illusione di una spontanea guarigione). In questa fase il dolore non si presentava più sollevando le ginocchia, bensì facendo forza sulle ginocchia, ovvero spingendo un pedale, saltando, appoggiando il piede anche solo camminando.
A giugno, dopo l’ennesima ricomparsa del dolore, che per 10 giorni mi rende insopportabile anche camminare, abbandono completamente l’attività fisica, cambio ortopedico e conservo solo il nuoto, giacché questo non mi provoca dolore. Il nuovo ortopedico, dopo la visita, mi consente di praticare solo il nuoto, mi assegna vari esercizi da svolgere quotidianamente, mi consiglia di indossare una fascia sottorotulea per almeno 3 ore al giorno, mi diagnostica un’infiammazione della plica sinoviale e mi assicura che seguendo la sua terapia, di durata 4-6 mesi, probabilmente non sarà necessario asportare la plica. Infine mi dà un appuntamento a fine agosto per effettuare una visita biomeccanica. Ora, a fine luglio, il dolore è diminuito, riducendosi a semplice fastidio ma non accenna a scomparire del tutto, e si fa sentire soprattutto camminando in discesa o stando in piedi a lungo.
Provo a descrivere il dolore: si presenta come un senso di instabilità sulle ginocchia, accompagnato da uno scrocchio su ambo i ginocchi, specie il dx, all’incirca alla metà della fase di distensione della gamba. Quando ancora andavo in bicicletta e a karate, notavo che il dolore tendeva a scomparire, seppur a tratti, dopo la fase di riscaldamento. Al termine dell’allenamento il dolore, e i relativi scrocchi non si facevano risentire per alcune ore.
Mi chiedo se la causa del dolore non stato il running, introdotto appena 5 mesi prima della comparsa della patologia, poiché la sola pratica combinata di bici e Karate, effettuata già nei 3 anni precedenti, non aveva mai presentato effetti collaterali.
Grazie ancora, voglia scusare la lungaggine, ma volevo essere più preciso possibile.