Effetti nel tempo del clomid

Gentili dottori, vorrei sottoporre alla vostra gentile attenzione la mia situazione.
Ho 30 anni e per circa un anno ho cercato una gravidanza, dopo un aborto spontaneo a 13+5 e due "mancati impianti" con concepimento avvenuto al primo tentativo (per gli aborti ho effettuato una serie di esami dai quali è emerso solo la mutazione MTHFR C667T in omozigosi, quindi aborti avvenuti per pura casualità e tanta sfortuna).
Ho dei cicli molto sballati da sempre, con una media di 35-37 gg di ciclo. Ho fatto dei tentativi con temperatura basale e stick ma a causa della non regolarità del ciclo ho sempre faticato a "beccare" il momento giusto. Ad aprile abbiamo tentato un primo ciclo di stimolazione con clomid, 1 cp al giorno per 5 giorni e gonasi 5000 quando è stato individuato ecograficamente un follicolo pronto allo scoppio, il tutto è sempre avvenuto comunque sotto monitoraggi ecografici (ultima eco presentava una situazione di normalità con corpo luteo). Il ciclo mi si è ripresentato normale, senza particolari dolori come avveniva prima. Alla fine del flusso mestruale però ho avuto un episodio di fortissimi dolori al basso ventre, placati grazie all'aulin, che che la ginecologa ha attribuito a dolori mestruali compatibili alla stimolazione.
Nella fase pre ovulatoria ho avuto delle perdite giallognole liquide come quando ho assunto il clomid.
Il nuovo flusso mestruale sempre con pochi dolori, dopo 3 gg dalla fine del flusso ho avuto ancora un episodio di crampi molto forti ed ora perdite giallognole.
Possibile che questi disturbi possano essere ancora uno strascico della stimolazione? La mia ginecologa mi ha consigliato di aspettare un altro ciclo e, nel caso si ripresentasse ancora il disturbo, di andare da lei per un controllo.
Ho comunque paura per la mia salute riproduttiva, anche perchè ho una ciste forse endometriosa che al momento ritengono di dover solamente tener controllata (28 mm).
Non sto facendo stimolazioni ne altro in quanto abbiamo deciso di staccarci un pochino dalla ricerca ossessiva in quanto mi stava logorando, abbiamo rapporti quando ne abbiamo voglia senza dipendere da temperatura, stick e quant'altro, però questi episodi non mi lasciano per nulla tranquilla.
Spero di essere stata abbastanza chiara e di non aver fatto confusione, ma vorrei sentire anche un parere di voi medici.
Cordialmente.
SG