Citrobacter freundii

Egregi dottori, scrivo questo post per un consulto/parere pur considerando i limiti di un consulto online.
Soffro di ernia iatale e gastrite cronica diagnosticate tramite EGDS due anni fa.
Ultimamente avevo delle nausee e un senso di andare in bagno con annesso malessere, molto brutto e mi sono fatto vedere da un gastroenterologo, costui mi ha fatto fare le analisi delle feci, sangue occulto, helicobacter fecale e calprotectina, tutte negative eccetto la coprocoltura dove mi trovano un batterio che si chiama Citrobacter Frendii e il gastroenterologo mi consiglia di provare a curarlo con degli antibiotici, altrimenti si opta per la pista colecisti.
Mi prescrive, dunque, il bactrim con protezione stomaco annesse(Omeoprazen) e fermenti lattici (Prolactis).
Purtroppo ho dovuto sospendere la cura per un peggioramento dei sintomi, i malesseri erano diventati più forti ed inoltre mi è venuto un nuovo sintomi: mi sento qualcosa nella trachea/esofago, un fastidio tipo come cibo indigerito, molto strano; inoltre ieri, dopo un weekend di pasti abbondanti sono stato molto male, solo andando in bagno ed espellendo muco vischioso stavo bene, il tutto peggiorato da un principio di influenza.
Secondo voi può essere il batterio a portarmi tutto questo ? Premetto che a breve ho l'analisi delle feci e la visita di controllo.
Cordiali Saluti, Antonio.