Antibiotico e gastroprotettore

Buongiorno, da diversi mesi ho difficoltà a digerire e frequente nausea. Ho intolleranze alimentari al lattosio e sorbitolo ma andando avanti da mesi con nausea e dispepsia il mio medico mi ha consigliato di fare una gastroscopia con la quale non è risultato niente: ne ernia ietale ne gastrite ne ulcere. Ora ho un dente del giudizio che fa male e il mio dentista ha detto di fare un ciclo di antibiotici e antinfiammatori. Devo prendere un gastroprotettore(ho in cada del pantoprazolo) per prendere l antibiotico? Perchè nonostante dalla gastroscopia non sia risultato niente ho comunque frequentemente problemi di stomaco. Grazie