Feci scure dopo cura antibiotica prolungata di due mesi

Buon giorno dottore a seguito di un urinocoltura eseguita nel mese di giugno dove mi è stata trovata la klebsiella pneumoniae nelle urine, il mio urologo mi ha prescritto una cura di ciproxin per dieci giorni, poi siccome non passava mi è stato richiesto di ripeterla per dieci giorni ogni mese .Dieci giorni fa mi è stata cambiata la cura con agumentin e da tre giorni al mattino faccio delle feci liquide e scure.
Potrebbe essere la causa di continuo uso di antibiotici che mi hanno irritato l'intestino o qualche cosa di più grave ?
Grazie mille dottore ma sono abbastanza preoccupato.