Assunzione pantoprazolo

Gentili Dottori,
scrivo per chiedere se è il caso di assumere le compresse di pantoprazolo che mi ha prescritto il mio medico, malgrado la mia situazione sia cambiata. Mi spiego qui di seguito.
Ho 36 anni e da anni soffro di mal di stomaco e di pancia. Solitamente la mattina, dopo aver fatto colazione, nella zona del basso ventre a destra ho fitte piuttosto forti.
Da alcuni mesi poi, ho iniziato ad avere ogni giorno diarrea, quasi sempre la mattina e ho perso 5 kg peso (ora ne peso 48). Sono quindi andata dal mio medico che, prima mi ha fatto fare le analisi del sangue (valori nella norma, a parte neutrofili 1.50 <, neutrofili 33.8 %<, linfociti 53.2% >) e poi mi ha detto di prendere per un mese il pantorc 20 e nel frattempo di farmi analizzare le feci (ricerca Ag-H pilory).
Non ho iniziato subito la terapia e, nel frattempo, la diarrea mi è passata (dopo mesi!). Ho ancora spesso mal di pancia e tendo a sentire gonfiore allo stomaco abbastanza spesso, ma ciò che mi allarmava era la diarrea per così lungo tempo.
Ora, chiedo, è comunque opportuno che inizi la terapia con pantoprozolo? E nel frattempo che faccia analizzare le feci?
Ringrazio sin d'ora per le risposte.