Reflusso e antibiotici

Salve,
Sono una ragazza di 23 anni e da qualche settimana combatto con un reflusso continuo. Per curare un otite, una settimana fa, il mio medico curante mi ha prescritto degli antibiotici al mattino e dopo pranzo il Brufen (600 mg) ma senza prescrivermi la protezione per lo stomaco. Da premettere che, dopo una gastroscopia, un anno fa mi è stata diagnosticata un'ernia jatale da scivolamento e una gastrite eritematosa antrale con lago mucoso tinto di bile.
Due giorni dopo aver preso i medicinali che il mio medico mi aveva prescritto sono stata molto male, da allora continuo ad avere amaro in bocca e soprattutto bruciore nella parte superiore, dietro lo sterno.
In seguito mi è stato prescritto l'omeprazolo ma la situazione non sembra migliorare di molto. Il problema è che da 2 giorni ho i sintomi di un'infezione urinaria e ho molta paura di prendere antibiotici di nuovo. Nel frattempo ho prenotato una seconda gastroscopia per capire la gravità del problema. Cosa mi consiglia?